2003-2011
- 2011, Avril
- Des vols en partage de codes entre Spanair et Aegean Airlines sont lancés.
- 2011, Mars
- Nouvelle Destination : Bologne. Aegean renforce sa présence avec un aéroport supplémentaire en Italie.
- 2011, Janvier
- La Commission Européenne met un veto sur la possible fusion d’Olympic Air avec Aegean Airlines.
- 2010, Août
- Des vols en partage de codes entre Continental Airlines et Aegean Airlines sont lancés.
- 2010, Février
- Les actionnaires principaux d’Aegean Airlines et d’Olympic Air s’accordent sur la fusion de leurs activités respectives
- 2010, Janvier
- Renforcement du réseau et nouveaux vols internationaux. Nouvelle destination : Tel-Aviv.
- 2010, Janvier
- Début du programme ''Aegean - Proche des jeunes''. Aegean fait voyager plus de 10.000 élèves afin qu'ils puissent visiter le nouveau musée de l'Acropole.
- 2009, Décembre
- Nouvelle destination : Madrid. Nouvelle route : Thessalonique – Milan.
- 2009, Novembre
- Initiative nationale d'Aegean. 2 nouveaux Airbus, le ''Kleisthenis'' et le ''Phidias'', font voyager le nouveau Musée de l'Acropole et la Grèce dans le monde entier.
- 2009, Octobre
- Aegean et bmi, filiale de Lufthansa et membre de Star Alliance, ont conclu un accord de coopération.
- 2009, Janvier
- Aegean et Brussels Airlines, la plus grande compagnie aérienne belge, ont signé un accord de coopération, permettant aux deux compagnies d’effectuer des vols avec un code commun dans le cadre de leurs réseaux.
- 2008, Septembre
- Aegean a obtenu la certification ISO 14001:2004. Aegean a mis en œuvre un système de gestion environnementale pour le service des passagers – service des avions et entretien des avions.
- 2008, Janvier
- Augmentation des commandes totales d’avions Airbus Α320/Α321 de 25 à 27. Les commandes totales concernent 23 Airbus Α320 et 4 Airbus Α321.
- 2007, Septembre
- Aegean commande 6 Airbus Α320 supplémentaires. Avec cette commande Aegean assure au total 25 avions de la famille Airbus A320.
- 2007, Juillet
- Introduction d’Aegean à la Bourse d’Athènes.
- 2007, Mars
- Réception des trois premiers Airbus A320.
- 2006, Juillet
- Achat de 3 Airbus A320 supplémentaires.
- 2006, Mars
- Aegean Airlines et TAP Portugal commencent une coopération étendue.
- 2005, Décembre
- Commande de 8 Airbus Α320 par Aegean Airlines dans la perspective de commander 12 avions supplémentaires de la même famille.
- 2005, Novembre
- Aegean s’associe avec Lufthansa. Dans le cadre de leur coopération, les deux compagnies offrent à leurs passagers des codes de vols communs et de nombreux avantages.
- 2004, Mai
- Nouvelle destination : Larnaca. Aegean commence les vols réguliers vers Chypre.
- 2004, Mai
- Uniformisation de la flotte uniquement avec des avions de type JET (13 Boeing 737 300/400 et 6 AVRO RJ100).